Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkn1bP46414 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkn1bP46414 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdkn1bP46414 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms