Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtgfrP43117 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtgfrP43117 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtgfrP43117 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtgfrP43117 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtgfrP43117 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtgfrP43117 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtgfrP43117 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms