Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc1a2P43006 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc1a2P43006 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc1a2P43006 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms