Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tac1P41539 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tac1P41539 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tac1P41539 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tac1P41539 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tac1P41539 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tac1P41539 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tac1P41539 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tac1P41539 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tac1P41539 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tac1P41539 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tac1P41539 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tac1P41539 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tac1P41539 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms