Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp3P39876 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp3P39876 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp3P39876 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp3P39876 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp3P39876 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp3P39876 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timp3P39876 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timp3P39876 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timp3P39876 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timp3P39876 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timp3P39876 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timp3P39876 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timp3P39876 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms