Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ifnar1P33896 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ifnar1P33896 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms