Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KrasP32883 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KrasP32883 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KrasP32883 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KrasP32883 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KrasP32883 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KrasP32883 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KrasP32883 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KrasP32883 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KrasP32883 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KrasP32883 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KrasP32883 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KrasP32883 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KrasP32883 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KrasP32883 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KrasP32883 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KrasP32883 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KrasP32883 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KrasP32883 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KrasP32883 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KrasP32883 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KrasP32883 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KrasP32883 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KrasP32883 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KrasP32883 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KrasP32883 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KrasP32883 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KrasP32883 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KrasP32883 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KrasP32883 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KrasP32883 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KrasP32883 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KrasP32883 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KrasP32883 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KrasP32883 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KrasP32883 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KrasP32883 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KrasP32883 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KrasP32883 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KrasP32883 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KrasP32883 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KrasP32883 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KrasP32883 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KrasP32883 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KrasP32883 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KrasP32883 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KrasP32883 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KrasP32883 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KrasP32883 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KrasP32883 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KrasP32883 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KrasP32883 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KrasP32883 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KrasP32883 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KrasP32883 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KrasP32883 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KrasP32883 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KrasP32883 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KrasP32883 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KrasP32883 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KrasP32883 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KrasP32883 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KrasP32883 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KrasP32883 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KrasP32883 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KrasP32883 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KrasP32883 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KrasP32883 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KrasP32883 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KrasP32883 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KrasP32883 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KrasP32883 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KrasP32883 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KrasP32883 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KrasP32883 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KrasP32883 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KrasP32883 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KrasP32883 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KrasP32883 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KrasP32883 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KrasP32883 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KrasP32883 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KrasP32883 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KrasP32883 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KrasP32883 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KrasP32883 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KrasP32883 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms