Protein–RNA interactions for Protein: P31649

Slc6a13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a13P31649 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc6a13P31649 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slc6a13P31649 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc6a13P31649 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a13P31649 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a13P31649 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms