Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VtnP29788 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VtnP29788 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VtnP29788 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VtnP29788 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VtnP29788 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VtnP29788 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VtnP29788 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VtnP29788 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VtnP29788 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VtnP29788 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VtnP29788 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VtnP29788 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VtnP29788 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VtnP29788 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VtnP29788 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VtnP29788 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
VtnP29788 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VtnP29788 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VtnP29788 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VtnP29788 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VtnP29788 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VtnP29788 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VtnP29788 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VtnP29788 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VtnP29788 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VtnP29788 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VtnP29788 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VtnP29788 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VtnP29788 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VtnP29788 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VtnP29788 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VtnP29788 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VtnP29788 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VtnP29788 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VtnP29788 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VtnP29788 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VtnP29788 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VtnP29788 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VtnP29788 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VtnP29788 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VtnP29788 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VtnP29788 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VtnP29788 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VtnP29788 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VtnP29788 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VtnP29788 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VtnP29788 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VtnP29788 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VtnP29788 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VtnP29788 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VtnP29788 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VtnP29788 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VtnP29788 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VtnP29788 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VtnP29788 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VtnP29788 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VtnP29788 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VtnP29788 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VtnP29788 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VtnP29788 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VtnP29788 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VtnP29788 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VtnP29788 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VtnP29788 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VtnP29788 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VtnP29788 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VtnP29788 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VtnP29788 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VtnP29788 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VtnP29788 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VtnP29788 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VtnP29788 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VtnP29788 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VtnP29788 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VtnP29788 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VtnP29788 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VtnP29788 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
VtnP29788 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VtnP29788 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VtnP29788 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VtnP29788 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VtnP29788 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VtnP29788 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VtnP29788 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VtnP29788 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VtnP29788 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VtnP29788 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VtnP29788 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VtnP29788 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VtnP29788 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VtnP29788 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VtnP29788 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VtnP29788 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VtnP29788 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.1 ms