Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Casp1P29452 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Casp1P29452 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Casp1P29452 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Casp1P29452 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Casp1P29452 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Casp1P29452 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Casp1P29452 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Casp1P29452 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casp1P29452 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Casp1P29452 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Casp1P29452 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Casp1P29452 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Casp1P29452 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Casp1P29452 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Casp1P29452 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casp1P29452 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms