Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp3P28862 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp3P28862 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp3P28862 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mmp3P28862 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms