Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxd11P23813 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxd11P23813 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxd11P23813 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxd11P23813 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxd11P23813 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxd11P23813 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxd11P23813 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxd11P23813 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxd11P23813 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
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