Protein–RNA interactions for Protein: P22272

Il6ra, Interleukin-6 receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6raP22272 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il6raP22272 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il6raP22272 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6raP22272 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6raP22272 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6raP22272 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il6raP22272 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Il6raP22272 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Il6raP22272 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il6raP22272 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il6raP22272 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il6raP22272 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il6raP22272 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Il6raP22272 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6raP22272 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6raP22272 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il6raP22272 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6raP22272 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Il6raP22272 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms