Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnnc2P20801 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnc2P20801 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnc2P20801 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnnc2P20801 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms