Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prim1P20664 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prim1P20664 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prim1P20664 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prim1P20664 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prim1P20664 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prim1P20664 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Prim1P20664 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prim1P20664 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prim1P20664 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prim1P20664 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prim1P20664 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prim1P20664 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prim1P20664 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms