Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcer1aP20489 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcer1aP20489 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms