Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18524 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18524 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18524 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18524 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18524 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18524 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18524 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18524 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18524 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18524 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18524 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18524 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18524 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18524 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18524 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18524 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18524 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18524 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18524 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18524 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18524 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18524 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18524 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18524 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18524 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18524 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18524 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
P18524 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18524 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18524 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18524 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18524 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
P18524 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18524 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18524 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18524 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
P18524 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms