Protein–RNA interactions for Protein: P18419

Svs4, Seminal vesicle secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs4P18419 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Svs4P18419 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Svs4P18419 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Svs4P18419 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Svs4P18419 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Svs4P18419 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Svs4P18419 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Svs4P18419 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Svs4P18419 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Svs4P18419 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Svs4P18419 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Svs4P18419 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Svs4P18419 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Svs4P18419 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Svs4P18419 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms