Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msh3P13705 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Msh3P13705 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh3P13705 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Msh3P13705 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Msh3P13705 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msh3P13705 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh3P13705 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh3P13705 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms