Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chrm1P12657 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrm1P12657 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms