Protein–RNA interactions for Protein: P0C8K7

Smim1, Small integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim1P0C8K7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim1P0C8K7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim1P0C8K7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim1P0C8K7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms