Protein–RNA interactions for Protein: P09542

Myl3, Myosin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl3P09542 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Myl3P09542 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myl3P09542 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myl3P09542 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myl3P09542 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Myl3P09542 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myl3P09542 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myl3P09542 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myl3P09542 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myl3P09542 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myl3P09542 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myl3P09542 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myl3P09542 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myl3P09542 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myl3P09542 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Myl3P09542 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myl3P09542 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myl3P09542 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myl3P09542 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myl3P09542 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myl3P09542 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myl3P09542 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myl3P09542 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myl3P09542 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myl3P09542 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms