Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb1P09055 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb1P09055 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itgb1P09055 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb1P09055 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms