Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01823 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01823 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01823 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01823 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01823 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01823 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01823 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01823 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01823 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01823 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01823 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01823 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01823 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01823 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01823 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01823 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01823 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01823 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01823 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01823 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01823 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01823 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01823 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01823 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01823 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01823 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01823 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01823 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01823 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01823 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01823 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01823 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01823 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01823 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01823 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01823 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01823 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01823 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01823 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01823 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01823 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01823 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01823 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01823 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01823 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01823 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01823 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01823 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01823 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01823 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01823 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01823 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01823 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01823 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01823 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01823 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01823 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01823 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01823 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01823 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01823 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01823 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01823 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01823 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01823 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01823 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01823 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01823 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01823 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01823 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01823 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01823 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01823 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01823 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01823 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01823 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01823 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01823 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01823 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01823 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01823 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01823 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01823 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01823 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01823 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01823 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01823 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01823 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms