Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01755 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01755 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01755 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01755 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01755 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01755 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01755 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01755 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01755 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01755 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01755 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01755 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01755 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01755 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01755 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01755 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01755 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01755 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01755 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01755 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01755 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01755 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01755 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01755 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01755 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01755 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01755 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01755 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01755 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01755 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01755 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01755 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01755 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01755 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01755 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01755 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01755 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01755 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01755 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01755 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01755 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01755 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01755 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01755 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01755 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01755 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01755 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01755 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01755 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01755 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01755 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01755 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01755 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01755 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01755 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01755 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01755 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01755 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01755 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01755 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01755 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01755 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01755 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01755 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01755 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01755 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01755 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01755 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01755 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01755 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01755 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01755 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01755 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01755 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01755 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01755 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01755 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01755 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01755 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01755 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01755 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01755 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01755 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01755 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01755 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01755 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01755 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01755 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01755 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01755 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01755 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01755 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01755 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01755 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01755 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01755 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01755 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01755 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01755 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms