Protein–RNA interactions for Protein: P01745

Ig heavy chain V region MPC 11, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01745 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01745 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01745 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01745 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01745 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01745 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01745 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01745 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01745 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01745 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01745 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01745 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01745 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01745 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01745 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01745 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01745 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01745 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01745 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01745 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01745 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01745 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01745 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01745 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01745 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01745 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01745 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01745 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01745 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01745 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01745 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01745 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01745 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01745 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01745 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01745 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01745 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01745 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01745 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01745 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01745 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01745 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01745 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01745 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01745 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01745 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01745 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01745 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01745 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01745 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01745 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01745 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01745 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01745 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01745 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01745 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01745 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01745 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01745 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01745 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01745 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01745 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01745 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01745 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01745 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01745 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01745 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01745 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01745 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01745 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01745 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01745 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01745 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01745 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01745 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01745 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01745 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01745 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01745 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01745 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01745 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01745 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01745 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01745 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01745 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01745 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01745 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01745 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01745 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms