Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01734 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01734 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01734 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01734 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01734 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01734 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01734 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01734 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01734 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01734 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01734 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01734 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01734 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01734 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01734 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01734 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01734 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01734 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01734 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01734 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01734 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01734 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01734 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01734 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01734 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01734 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01734 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01734 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01734 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01734 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01734 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01734 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01734 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01734 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01734 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01734 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01734 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
P01734 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01734 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P01734 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01734 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01734 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
P01734 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
P01734 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01734 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01734 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01734 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01734 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01734 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
P01734 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01734 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01734 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P01734 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01734 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01734 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01734 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01734 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01734 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01734 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01734 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01734 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01734 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01734 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
P01734 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01734 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01734 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01734 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01734 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01734 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01734 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01734 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01734 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01734 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01734 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01734 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01734 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01734 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01734 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01734 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01734 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01734 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01734 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01734 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01734 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01734 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01734 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01734 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01734 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01734 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01734 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01734 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01734 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01734 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01734 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01734 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P01734 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01734 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01734 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01734 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms