Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra6O70491 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra6O70491 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra6O70491 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra6O70491 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra6O70491 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra6O70491 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra6O70491 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra6O70491 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra6O70491 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms