Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra6O70491 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra6O70491 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra6O70491 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra6O70491 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra6O70491 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra6O70491 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra6O70491 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra6O70491 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra6O70491 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stra6O70491 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra6O70491 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra6O70491 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra6O70491 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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