Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Vamp4O70480 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Vamp4O70480 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vamp4O70480 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vamp4O70480 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vamp4O70480 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vamp4O70480 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vamp4O70480 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vamp4O70480 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vamp4O70480 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vamp4O70480 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vamp4O70480 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms