Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Lnx1O70263 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lnx1O70263 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lnx1O70263 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lnx1O70263 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lnx1O70263 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lnx1O70263 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lnx1O70263 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms