Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pja1O55176 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pja1O55176 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pja1O55176 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pja1O55176 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pja1O55176 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja1O55176 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja1O55176 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pja1O55176 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pja1O55176 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pja1O55176 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms