Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syngr1O55100 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syngr1O55100 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr1O55100 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms