Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChkaO54804 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ChkaO54804 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChkaO54804 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkaO54804 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChkaO54804 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChkaO54804 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkaO54804 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkaO54804 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms