Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl25O35903 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl25O35903 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl25O35903 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl25O35903 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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