Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dsg3O35902 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg3O35902 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dsg3O35902 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg3O35902 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms