Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Socs1O35716 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Socs1O35716 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Socs1O35716 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Socs1O35716 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Socs1O35716 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Socs1O35716 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Socs1O35716 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Socs1O35716 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Socs1O35716 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Socs1O35716 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs1O35716 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs1O35716 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Socs1O35716 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs1O35716 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs1O35716 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs1O35716 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs1O35716 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs1O35716 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs1O35716 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs1O35716 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Socs1O35716 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Socs1O35716 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.3 ms