Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-ObO35424 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-ObO35424 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-ObO35424 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms