Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2f3O35261 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2f3O35261 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f3O35261 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f3O35261 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2f3O35261 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f3O35261 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f3O35261 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E2f3O35261 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f3O35261 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f3O35261 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f3O35261 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f3O35261 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f3O35261 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f3O35261 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f3O35261 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f3O35261 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f3O35261 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2f3O35261 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f3O35261 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f3O35261 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms