Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpsf2O35218 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpsf2O35218 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpsf2O35218 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpsf2O35218 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms