Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe40O35185 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe40O35185 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe40O35185 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe40O35185 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe40O35185 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe40O35185 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe40O35185 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlhe40O35185 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlhe40O35185 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhe40O35185 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bhlhe40O35185 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhe40O35185 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe40O35185 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms