Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kcns1O35173 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Kcns1O35173 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Kcns1O35173 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kcns1O35173 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kcns1O35173 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kcns1O35173 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kcns1O35173 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kcns1O35173 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kcns1O35173 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kcns1O35173 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kcns1O35173 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kcns1O35173 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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