Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3aO08759 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ube3aO08759 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube3aO08759 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3aO08759 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms