Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Barx2O08686 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Barx2O08686 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Barx2O08686 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Barx2O08686 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Barx2O08686 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Barx2O08686 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Barx2O08686 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Barx2O08686 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Barx2O08686 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Barx2O08686 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Barx2O08686 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Barx2O08686 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Barx2O08686 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Barx2O08686 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Barx2O08686 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms