Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mesp2O08574 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mesp2O08574 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mesp2O08574 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp2O08574 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms