Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efna5O08543 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efna5O08543 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efna5O08543 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efna5O08543 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efna5O08543 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efna5O08543 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efna5O08543 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efna5O08543 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efna5O08543 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efna5O08543 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efna5O08543 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efna5O08543 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efna5O08543 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efna5O08543 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efna5O08543 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efna5O08543 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efna5O08543 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.9 ms