Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm379J3QQ19 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm379J3QQ19 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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