Protein–RNA interactions for Protein: J3QPJ5

Gm21776, Predicted gene, 21776, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21776J3QPJ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21776J3QPJ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21776J3QPJ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21776J3QPJ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21776J3QPJ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21776J3QPJ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21776J3QPJ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm21776J3QPJ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21776J3QPJ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21776J3QPJ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21776J3QPJ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21776J3QPJ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21776J3QPJ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21776J3QPJ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms