Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8298J3QPI0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8298J3QPI0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8298J3QPI0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm8298J3QPI0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms