Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm20918J3QN17 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20918J3QN17 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20918J3QN17 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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