Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp616J3QN14 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp616J3QN14 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp616J3QN14 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms